11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1475 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  29.06 
 
 		 399 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  28.49 
 
 		 399 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  28.49 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  28.41 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  27.41 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  26.93 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  27.61 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  27.89 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  26.11 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1252  hypothetical protein  32.08 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>