13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1841 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  61.63 
 
 		 374 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  58.14 
 
 		 374 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  66.67 
 
 		 374 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  49.06 
 
 		 399 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  49.06 
 
 		 399 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  49.06 
 
 		 399 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  48.11 
 
 		 399 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  69.49 
 
 		 387 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  37.31 
 
 		 384 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  40.32 
 
 		 357 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  41.3 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>