16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1532 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  743    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  97.33 
 
 
374 aa  697    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  95.45 
 
 
374 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  53.24 
 
 
399 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  52.82 
 
 
399 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  52.28 
 
 
399 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  52.97 
 
 
399 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  54.78 
 
 
387 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1842  hypothetical protein  69.83 
 
 
242 aa  295  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  31.47 
 
 
384 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1841  hypothetical protein  58.14 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  25.75 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  26.71 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  23.81 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  22.89 
 
 
1006 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  35.4 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>