17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1817 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  98.25 
 
 
399 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  94.74 
 
 
399 aa  730    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  95.99 
 
 
399 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  795    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  66.42 
 
 
387 aa  481  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  53.62 
 
 
374 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  52.82 
 
 
374 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  54.28 
 
 
374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1842  hypothetical protein  59.49 
 
 
242 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  33.04 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  26.78 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  27.4 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  27.54 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1841  hypothetical protein  49.06 
 
 
95 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  27 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1252  hypothetical protein  25.26 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  22.78 
 
 
1006 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>