32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1594 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  347  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  96.49 
 
 
171 aa  337  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  95.32 
 
 
171 aa  331  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  75.44 
 
 
171 aa  268  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  69.38 
 
 
171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  69.38 
 
 
171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  69.38 
 
 
171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  69.38 
 
 
171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  69.38 
 
 
171 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  53.09 
 
 
166 aa  154  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  46.84 
 
 
163 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  46.84 
 
 
166 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  44.94 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  37.82 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  41.84 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  40.51 
 
 
1006 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  40.56 
 
 
166 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  35.88 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  36.08 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  35.88 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  39.39 
 
 
551 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  35.47 
 
 
176 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  35.88 
 
 
552 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  30.27 
 
 
200 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  30.82 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  31.58 
 
 
703 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  26.71 
 
 
697 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.47 
 
 
196 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  33.85 
 
 
189 aa  44.3  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  33.85 
 
 
189 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.85 
 
 
196 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  28.38 
 
 
219 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>