31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1476 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  53.09 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  52.17 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  55.63 
 
 		 171 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  49.69 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  49.69 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  49.07 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  44.1 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  49.07 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  49.07 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  44.72 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  40.99 
 
 		 1006 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  39.16 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  39.16 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  39.16 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  42.76 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  40.74 
 
 		 551 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  43.33 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  37.66 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  38.85 
 
 		 552 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  34.36 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  37.34 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  35.76 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  28.03 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  27.06 
 
 		 697 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  48.65 
 
 		 703 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  31.87 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.87 
 
 		 196 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>