30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4248 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1031    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  41.71 
 
 		 551 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  46.67 
 
 		 166 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  47.3 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  43.87 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  45.16 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  45.22 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  38.55 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  38.55 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  37.95 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1006 aa  108  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  36.26 
 
 		 171 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  38.85 
 
 		 166 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  36.26 
 
 		 171 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  35.88 
 
 		 171 aa  97.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  37.33 
 
 		 166 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  33.97 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  30.65 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  23.66 
 
 		 703 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  29.88 
 
 		 697 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  37.29 
 
 		 189 aa  50.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  37.29 
 
 		 189 aa  50.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  26.6 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>