28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1843 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  76.02 
 
 		 171 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  75.44 
 
 		 171 aa  268  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  74.85 
 
 		 171 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  65.24 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  65.24 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  65.24 
 
 		 171 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  65.24 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  66.24 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  44.87 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  47.83 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  44.72 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  47.17 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  41.36 
 
 		 1006 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  36.02 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  37.97 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  37.14 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  37.14 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  37.14 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  35.46 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  36.81 
 
 		 551 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  36.09 
 
 		 552 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  27.03 
 
 		 200 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  27.95 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30.41 
 
 		 703 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  27.95 
 
 		 697 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>