32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1846 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  53.85 
 
 
171 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  53.85 
 
 
171 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  53.85 
 
 
171 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  53.85 
 
 
171 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  46.84 
 
 
171 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  46.84 
 
 
171 aa  141  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  44.1 
 
 
166 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  44.87 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  45.57 
 
 
171 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  43.67 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  39.74 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  38.75 
 
 
1006 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  39.18 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  39.18 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  39.1 
 
 
163 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  37.93 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  34.81 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  32.47 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  34.84 
 
 
551 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  33.97 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  37.33 
 
 
552 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  25.9 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  34.15 
 
 
703 aa  64.7  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  28.75 
 
 
697 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.67 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.59 
 
 
196 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  39.51 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  39.68 
 
 
193 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>