33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1533 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  96.49 
 
 		 171 aa  337  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  97.08 
 
 		 171 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  76.02 
 
 		 171 aa  270  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  69.38 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  69.38 
 
 		 171 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  69.38 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  69.38 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  65.5 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  52.17 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  46.84 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  46.84 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  44.94 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1006 aa  121  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  43.26 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  36.71 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  40.14 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  38.1 
 
 		 552 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  38.79 
 
 		 551 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  30.81 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.33 
 
 		 703 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  27.33 
 
 		 697 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.47 
 
 		 196 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  35.38 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  35.38 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  28.38 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.98 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4394  hypothetical protein  26.06 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.130014  normal  0.518718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>