34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3195 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  336  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  63.86 
 
 		 164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  47.13 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  36.05 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  44.03 
 
 		 551 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  39.88 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  45.22 
 
 		 552 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  35.47 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  35.47 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1006 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  40.82 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  37.66 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  40.56 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  40.14 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  39.29 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  34.81 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  38.69 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  36.48 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  31.17 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  29.74 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30.5 
 
 		 703 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  29.79 
 
 		 697 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  31.4 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  25.14 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  25.14 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  32.53 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  40.68 
 
 		 196 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.41 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>