34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2509 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  87.12 
 
 		 163 aa  298  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  53.33 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  44.94 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  47.83 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  44.94 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  44.94 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  43.23 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  43.23 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  42.58 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  42.58 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  41.94 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  41.51 
 
 		 551 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  43.87 
 
 		 552 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  40.51 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  39.41 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  39.41 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  38.95 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  37.42 
 
 		 1006 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  39.04 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  35.76 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  31.48 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  36.48 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  27.75 
 
 		 200 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  26.97 
 
 		 703 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  27.56 
 
 		 697 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.19 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  41.46 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  41.46 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  35.48 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  37.74 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>