20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2659 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  35.53 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.22 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  34 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  37.04 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  37.57 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  36.51 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  34.03 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  34.93 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  35.22 
 
 		 703 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  30.65 
 
 		 697 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  27.63 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  26.34 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1085  hypothetical protein  32.2 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0472517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2239  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  27.98 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1006 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  39.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  43.59 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>