14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0370 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2239  hypothetical protein  66.2 
 
 
212 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.79 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.72 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  31.43 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  30.86 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  26.67 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  27.01 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  26.44 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  26.92 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  25.48 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  25.95 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  25.81 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  24.64 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>