13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1097 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  433  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  47.51 
 
 
174 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  31.95 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  29.71 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.4 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  26.78 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  23.45 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.34 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  26.23 
 
 
189 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  25.62 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>