14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1894 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  100 
 
 
174 aa  350  5e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  47.51 
 
 
216 aa  154  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  31.29 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  30.91 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  27.42 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  28.74 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  24.32 
 
 
697 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  28.16 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.47 
 
 
196 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1461  hypothetical protein  24.7 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.790498  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  27.22 
 
 
235 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  26.01 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  25.17 
 
 
703 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.92 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>