20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2355 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  53.8 
 
 
190 aa  208  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  31.95 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  30.91 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.88 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.08 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  26.92 
 
 
219 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  29.45 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  30.91 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  29.65 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.77 
 
 
703 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  29.07 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  28.18 
 
 
697 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  32.53 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  25.81 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  38.6 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  29.03 
 
 
551 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  42.22 
 
 
1006 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>