38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0897 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  99.47 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  72.49 
 
 		 189 aa  284  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  40.1 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.8 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  36.51 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.03 
 
 		 703 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2239  hypothetical protein  29.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  26.06 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1006 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  28.16 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  24.59 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  37.29 
 
 		 552 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  24.59 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  24.59 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  24.59 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  36.76 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  32.97 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  26.23 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  25.14 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  26.44 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  39.62 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  35.38 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  25.68 
 
 		 551 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  41.46 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  25.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  24 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  25.77 
 
 		 697 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  32.97 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  25.86 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>