41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1504 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  91.84 
 
 
196 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  52.58 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  44.44 
 
 
189 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  40.62 
 
 
189 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  40.1 
 
 
189 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  34 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  31.61 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.12 
 
 
703 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2239  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  31.08 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  33.52 
 
 
697 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  31.72 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  25.98 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  29.94 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  26.16 
 
 
1006 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1461  hypothetical protein  26.19 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.790498  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1591  hypothetical protein  30.91 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  25.34 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  27.47 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  27.47 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  25.27 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  25.27 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  27.22 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  23.43 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4401  hypothetical protein  27.95 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.493627  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  26.92 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  27.47 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  25.82 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1085  hypothetical protein  22.4 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0472517  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  35.19 
 
 
163 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  35.19 
 
 
163 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  23.43 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  22.45 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4378  hypothetical protein  28.48 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  38.98 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  23.47 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  22.86 
 
 
171 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  28.41 
 
 
166 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4245  hypothetical protein  28.48 
 
 
172 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>