43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2228 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1372    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  50.14 
 
 
703 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  29.81 
 
 
166 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.09 
 
 
196 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  30.45 
 
 
551 aa  64.3  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  30.28 
 
 
163 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  28.75 
 
 
166 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  57.14 
 
 
161 aa  62.4  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  27.71 
 
 
176 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  27.71 
 
 
176 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  27.56 
 
 
163 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.52 
 
 
196 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  27.04 
 
 
176 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  26.63 
 
 
160 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  32.03 
 
 
164 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  27.95 
 
 
171 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  40.24 
 
 
336 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  26.71 
 
 
189 aa  54.3  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  24.32 
 
 
174 aa  53.5  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  30.7 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  35.62 
 
 
1006 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  35.96 
 
 
323 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  27.33 
 
 
171 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  26.71 
 
 
171 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  27.06 
 
 
166 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  34.92 
 
 
171 aa  48.5  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  27.92 
 
 
367 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  29.79 
 
 
166 aa  48.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  31.5 
 
 
431 aa  47.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  26.38 
 
 
189 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  26.71 
 
 
171 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  28.18 
 
 
183 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  26 
 
 
219 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  29.08 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  25.62 
 
 
190 aa  44.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  28.48 
 
 
363 aa  44.3  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  35.8 
 
 
735 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>