35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1296 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  333  7.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  33.97 
 
 
166 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  32.32 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  31.48 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  36.99 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  31.17 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  36.48 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  33.55 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  34.19 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  31.33 
 
 
551 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  33.33 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  32.34 
 
 
1006 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  30.22 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  30.82 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  30.22 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  28.03 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  31.32 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  30.82 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  30.82 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  27.95 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  57.14 
 
 
697 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  57.14 
 
 
703 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  38.33 
 
 
200 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  39.62 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  39.62 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  41.82 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.98 
 
 
196 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.98 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  38.6 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  41.38 
 
 
199 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>