28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1651 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  34.57 
 
 
166 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  35.67 
 
 
1006 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  30.81 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  30.81 
 
 
171 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  30.27 
 
 
171 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  30.73 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  30.73 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  31.52 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  28.11 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  30.43 
 
 
171 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  29.89 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  30.43 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  29.89 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  29.63 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  32.92 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  31.64 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  30.48 
 
 
552 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  29.76 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  29.02 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  29.12 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  28.41 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  27.75 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  25.9 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  38.33 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  43.86 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  46.51 
 
 
703 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  43.14 
 
 
697 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>