26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1619 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  63.5 
 
 
389 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  62.78 
 
 
395 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  63.31 
 
 
387 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  64.58 
 
 
384 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  58.62 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  59.94 
 
 
354 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  59.24 
 
 
354 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  58.94 
 
 
354 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  38.83 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  32.37 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  35.91 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  31.83 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  34.91 
 
 
442 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  41.1 
 
 
1006 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  34.92 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  29.91 
 
 
735 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  29.91 
 
 
735 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  36.14 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  33.52 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  37.24 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  38.94 
 
 
325 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  34.73 
 
 
351 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  26.92 
 
 
758 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30 
 
 
703 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  27.37 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>