26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1840 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  72.24 
 
 
354 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  71.67 
 
 
354 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  71.31 
 
 
354 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  59.19 
 
 
389 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  57.96 
 
 
395 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  58.4 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  59.57 
 
 
384 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  58.62 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  39.5 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  32.67 
 
 
363 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  32.85 
 
 
442 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  29.91 
 
 
446 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  46.97 
 
 
1006 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  29.47 
 
 
735 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  29.15 
 
 
735 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  30.04 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  35.2 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  27.79 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  33.78 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  34 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  30.41 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
758 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  29.41 
 
 
703 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>