26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2992 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  99.59 
 
 
735 aa  1449    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1455    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  25.58 
 
 
758 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  33.01 
 
 
446 aa  111  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  28.26 
 
 
387 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  28.29 
 
 
389 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  27.1 
 
 
395 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  28.46 
 
 
384 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  40.91 
 
 
312 aa  98.6  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  34.62 
 
 
442 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  37.59 
 
 
354 aa  94.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  37.59 
 
 
354 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  35.06 
 
 
336 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  37.59 
 
 
354 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  35.24 
 
 
1006 aa  81.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  38.89 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  35.5 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  34.78 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  29.27 
 
 
325 aa  58.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  33.73 
 
 
351 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  26.17 
 
 
357 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  38.71 
 
 
363 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  26.36 
 
 
357 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  35.8 
 
 
697 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>