25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1531 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  96.61 
 
 		 354 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  98.02 
 
 		 354 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  71.31 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  56.27 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  57.68 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  56.68 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  58.11 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  58.94 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  37.05 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.25 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  34.12 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  34.35 
 
 		 442 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  29.94 
 
 		 735 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  29.62 
 
 		 735 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  43.94 
 
 		 1006 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  34.44 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  39.11 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  29.97 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  28.7 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  31.76 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  36.76 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  27.92 
 
 		 758 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 703 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  30.88 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>