19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1595 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  909    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  41.45 
 
 
476 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  42.92 
 
 
478 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  33.33 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  29.84 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  29.03 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  29.03 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  24.51 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  27.1 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  23.08 
 
 
416 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  30.3 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  27.33 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  26.03 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  32.76 
 
 
334 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  32.57 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  29.7 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  22.73 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  27.37 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>