16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4244 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  100 
 
 
439 aa  812    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  94.76 
 
 
439 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  93.62 
 
 
439 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  57.95 
 
 
436 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  32.79 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  31.82 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  27.46 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  26.28 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  27.81 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  33.59 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  32.75 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  33.09 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  33.09 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  40.24 
 
 
334 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1462  hypothetical protein  34.68 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.738512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>