16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1098 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  819    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  41.75 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  27.19 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  26.3 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  31.82 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  27.1 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  32.26 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  28.82 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  25 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  30.16 
 
 
370 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  37.38 
 
 
334 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  28.35 
 
 
436 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  28.33 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  27.27 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  26.67 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  26.06 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>