18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2356 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  100 
 
 		 442 aa  872    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  68.89 
 
 		 445 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  27.76 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  26.73 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  24.51 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  24.55 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.75 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1701  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.55 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  57  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  26.19 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  25.4 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  25.4 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  28 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  28.48 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  27.19 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  25.37 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  24.43 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  26.97 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>