21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2480 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  100 
 
 		 370 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  44.38 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1701  conserved hypothetical conserved membrane protein  45.22 
 
 		 367 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  34.2 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  33.25 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  34.53 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  31.75 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  28.78 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  31.2 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  30.16 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  34.62 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  26.62 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  26.03 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  34.78 
 
 		 703 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  32.56 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  28.14 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  33.61 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  32.77 
 
 		 439 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  33.61 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  25.66 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>