24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2447 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  47.02 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  34.73 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  48.21 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  33.1 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  32.1 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  32.1 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  31.06 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  29.09 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  32.1 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  41.24 
 
 
1006 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  35.77 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  38.33 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  34.07 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  36.72 
 
 
395 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  40 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  35.48 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  36.67 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 
735 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  33.33 
 
 
735 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  41.3 
 
 
442 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  31.48 
 
 
758 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  59.57 
 
 
363 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  39.85 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>