26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3070 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1456    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  99.59 
 
 
735 aa  1449    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  25.58 
 
 
758 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  33.01 
 
 
446 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  28.26 
 
 
387 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  28.54 
 
 
389 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  27.54 
 
 
395 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  41.56 
 
 
312 aa  99.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  28.19 
 
 
384 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  38.3 
 
 
354 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  35.71 
 
 
336 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  34.62 
 
 
442 aa  94.7  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  38.3 
 
 
354 aa  94  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  38.3 
 
 
354 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  35.24 
 
 
1006 aa  81.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  31.31 
 
 
342 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  34.78 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  35.5 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  30.54 
 
 
325 aa  57.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  33.73 
 
 
351 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  26.17 
 
 
357 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  38.84 
 
 
363 aa  50.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  26.36 
 
 
357 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.71 
 
 
703 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>