120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4744 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  254  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  33.9 
 
 
386 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  39.45 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  39.45 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  37.96 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  36.94 
 
 
318 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  35.51 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  50.85 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  32.5 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  39.81 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.5 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.67 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  30.33 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  30.33 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  35.14 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  31.54 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.04 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  33.06 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  34.17 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  32.14 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  32.14 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  32.14 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  32.14 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  30.7 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  42.53 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  30.97 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  31.67 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  34.4 
 
 
143 aa  57  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  32.19 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  32.28 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  33.06 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  33.06 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  33.06 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  33.83 
 
 
200 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  32.28 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  37.11 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  32.5 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  29.86 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  28.7 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  34.25 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  37.84 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.11 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  34.82 
 
 
355 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  31.25 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  38.53 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  33.93 
 
 
360 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  32.48 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  32.19 
 
 
140 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  31.16 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  28.78 
 
 
142 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  29.41 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  30.56 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  31.88 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3540  hypothetical protein  31.45 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.489902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  36.94 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  30.43 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  26.57 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  30.97 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  29.2 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  29.73 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  31.97 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  34.86 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  40.32 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  42.22 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  36.75 
 
 
168 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  28.68 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  28.04 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  30.5 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  53.12 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  27.45 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  32.46 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  33.06 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 
230 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  27.45 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  27.46 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  36.7 
 
 
310 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5221  hypothetical protein  34.03 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170062  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  35.37 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  27.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>