41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0415 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  42.95 
 
 		 318 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  38.37 
 
 		 360 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 355 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  44.3 
 
 		 120 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  34.51 
 
 		 304 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  31.36 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  35.21 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  33.04 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  32.14 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  32 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  31.34 
 
 		 134 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  36.51 
 
 		 123 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  34.29 
 
 		 123 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  40.38 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  34.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  38.46 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  43.18 
 
 		 125 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  22.02 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  31.52 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  45.24 
 
 		 109 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  38.3 
 
 		 168 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  42.22 
 
 		 117 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  42.22 
 
 		 117 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  34.88 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  29.31 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  34.85 
 
 		 112 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  38.6 
 
 		 146 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>