42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2546 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4631  protein of unknown function DUF805  50 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.276161  normal  0.187204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.23 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  44.76 
 
 		 286 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  35.14 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  34.86 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  37.14 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  34.86 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  34.86 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.04 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  35.71 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  31.68 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.14 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  34.23 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  30.56 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.48 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  34.19 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  32.08 
 
 		 355 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  33.02 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  29.17 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  32.11 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  34.58 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  27.12 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  30.28 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  30.51 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  27.5 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  29.2 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  29.2 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  29.2 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>