59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0810 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  62.5 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  35.9 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  32.65 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  29.73 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  32.05 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  35.22 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  33.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  29.53 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  31.54 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  29.33 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  28.86 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  28.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  31.72 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  31.72 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  30.72 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  31.72 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  31.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  28.19 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  28.28 
 
 		 129 aa  50.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  31.79 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  27.46 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  28.19 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  28.87 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  27.46 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  25.53 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  29.49 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.59 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  26.71 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  34.25 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  29.86 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  25.14 
 
 		 152 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  26.24 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  29.08 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  24.54 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  24.54 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  31.4 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  38.03 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>