45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4299 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  99.3 
 
 
142 aa  278  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  99.29 
 
 
142 aa  277  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  99.29 
 
 
142 aa  276  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  98.59 
 
 
142 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  89.44 
 
 
146 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  88.73 
 
 
146 aa  261  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  88.73 
 
 
146 aa  260  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  90.7 
 
 
129 aa  236  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  68.31 
 
 
144 aa  196  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  68.31 
 
 
153 aa  196  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  60.43 
 
 
140 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  60.43 
 
 
140 aa  184  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  63.57 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  68.79 
 
 
141 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  58.87 
 
 
141 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  63.33 
 
 
122 aa  153  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  34.01 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  30.34 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  30.19 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  37.18 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  29.93 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  31.21 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  30.08 
 
 
386 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.91 
 
 
1123 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  37.14 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  27.89 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  26.9 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  27.46 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  32.1 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  40.28 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.65 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.65 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.65 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.65 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.88 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>