80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0629 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  100 
 
 		 157 aa  308  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  35.03 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  34.72 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  31.68 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  31.55 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  33.56 
 
 		 386 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  34.44 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  32.62 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  32.03 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  31.54 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  31.76 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  30.82 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  34.01 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  32.48 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  32.48 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  33.56 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.97 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  32.48 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  32.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  32.68 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  26.35 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  33.96 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  27.16 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  29.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  33.56 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  27.08 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  33.56 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  30.56 
 
 		 113 aa  47.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  47.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  27.33 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  27.33 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  28.98 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  27.15 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  31.21 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  25.87 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  27.81 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  29.71 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  26.57 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  29.53 
 
 		 122 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  25.68 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  33.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  34.18 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  32.65 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  27.08 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  31.91 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  36.49 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  27.27 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  28.77 
 
 		 120 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  32.43 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  30.34 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  28.41 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  28.41 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  22.82 
 
 		 116 aa  40.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>