56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1932 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  52.08 
 
 
221 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  29.41 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  30.48 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  29.41 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  30.7 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  29.63 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  40.32 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  42.59 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  34.91 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  36.11 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  36.11 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  32.46 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  31.9 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  26.83 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.01 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  28.95 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  29.82 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  27.86 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  28.18 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  25.35 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  29.82 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  27.36 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  25.45 
 
 
286 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  31.33 
 
 
146 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  41.18 
 
 
200 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  37.04 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  26.83 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  33.87 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  29.82 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  43.14 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  27.64 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  31.21 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  25.69 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  25.69 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  25.69 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.1 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  25.62 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  25.62 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  25.62 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  25.62 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  37.93 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>