77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4184 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  39.31 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  40.13 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  32.29 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  36.13 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  31.25 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  31.43 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  35.92 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.86 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  30.97 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  36.54 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  25.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  34.51 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  33.87 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  30.48 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  51.2  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  32.08 
 
 		 109 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  32.41 
 
 		 109 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  26.02 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  34.38 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.11 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.11 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  32.04 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  29.6 
 
 		 126 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  32.29 
 
 		 123 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  28.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  28.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  32.31 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  30.47 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  31.21 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  32.67 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  29.45 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  29.17 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  31.31 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  31.97 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  29.41 
 
 		 113 aa  45.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  33.04 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  31.08 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  31.82 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  32.11 
 
 		 125 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  26.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  26.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  26.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  26.32 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  31.43 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  32.41 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  49.02 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.71 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.41 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  27.83 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  30.56 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  27.08 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  32.41 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  35.14 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  29.63 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  29.55 
 
 		 168 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  31.2 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  30.36 
 
 		 109 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  24.8 
 
 		 129 aa  41.2  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  22.64 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  22.64 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>