53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001758 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  85.71 
 
 		 140 aa  223  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  52.48 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  35.03 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  34.27 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  36.11 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  35.9 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  31.97 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  32.19 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  33.1 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  35.17 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  30.34 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  32.37 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  31.47 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  33.57 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  31.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.95 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.95 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.57 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  26.87 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  24.65 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  36.26 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.91 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  22.6 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  25 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  32.22 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  25.48 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  25.56 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  30.86 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  26.06 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  26.39 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>