28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3162 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  27.15 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  31.54 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  31.11 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  32.26 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  29.2 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  29.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  30.6 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  35 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.83 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  29.6 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  30.4 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  28.8 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.35 
 
 
117 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.35 
 
 
117 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>