82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2241 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  52.48 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  56.74 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  39.16 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  39.31 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  39.1 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  35.17 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  35.37 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  36.05 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  34.01 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  34.01 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  36.81 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  35.97 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  31.17 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  34.42 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  29.61 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  32.87 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  28.17 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  31.76 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  31.58 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  34.25 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  31.33 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  34.09 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  28.86 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.05 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  26.47 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  26.47 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  26.47 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  33.7 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  27.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  26.47 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  34.65 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  27.41 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  25.17 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  27.03 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  22.14 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  25.74 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  28.47 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  25 
 
 		 122 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  28.77 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  25 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  31.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1391  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  32.58 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3540  hypothetical protein  25.95 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.489902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  24.26 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  24.26 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  24.26 
 
 		 121 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  24.26 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 68 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>