24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3540 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3540  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.489902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  33.71 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  39.68 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  31.13 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  32.29 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  30.36 
 
 		 386 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.65 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  29.73 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  38.1 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  27.37 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  30.17 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  34.02 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  33.96 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  33.96 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  39.71 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  30.69 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  31.46 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>