98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0640 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  796    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  35.25 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  36.11 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  32.2 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  33.56 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.36 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.36 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  30.89 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  30.07 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  32.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  32.77 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.93 
 
 		 118 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  32.2 
 
 		 122 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  47.92 
 
 		 121 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  32.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  31.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.62 
 
 		 120 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  31.36 
 
 		 168 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  28.47 
 
 		 141 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.48 
 
 		 131 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  27.83 
 
 		 126 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.35 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  27.4 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  28.46 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30.25 
 
 		 121 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  29.1 
 
 		 140 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  28.72 
 
 		 125 aa  49.7  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  30.41 
 
 		 360 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  28.97 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 123 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  35.48 
 
 		 116 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  31.13 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  31.86 
 
 		 121 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  35.59 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  32.32 
 
 		 129 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  31.06 
 
 		 129 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  24.32 
 
 		 115 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  28.36 
 
 		 140 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  28.47 
 
 		 139 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  29.8 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36.59 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  26.09 
 
 		 116 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  31.53 
 
 		 121 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  32.48 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  30.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  31.53 
 
 		 121 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  31.53 
 
 		 121 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  31.53 
 
 		 121 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  29.57 
 
 		 125 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  30.86 
 
 		 122 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  32.79 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  29.09 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 		 141 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  29.36 
 
 		 123 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  30.63 
 
 		 121 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  30.1 
 
 		 137 aa  42.7  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>