86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3806 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  75.71 
 
 
141 aa  207  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  68.35 
 
 
140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  67.63 
 
 
140 aa  190  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  63.57 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  63.57 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  63.57 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  63.57 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  63.57 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  60 
 
 
146 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  59.29 
 
 
146 aa  174  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  63.91 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  63.91 
 
 
153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  56.83 
 
 
139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  62.02 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  60.71 
 
 
141 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  59.46 
 
 
122 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  30.34 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  32.62 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  29.86 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  29.53 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  31.46 
 
 
155 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  29.45 
 
 
140 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  34.48 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  32.12 
 
 
215 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.67 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.88 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  30.38 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  30.38 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  31.11 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  32.99 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  38.36 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  31.11 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  31.11 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  32.99 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  31.11 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  32.1 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  28.97 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  24.84 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  37.68 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  35 
 
 
393 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  30.77 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  30.12 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  28.89 
 
 
1123 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  31.88 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  27.94 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  23.24 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  35.9 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  26.32 
 
 
386 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  28.12 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  28.8 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  28.12 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  28.12 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  30.26 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  30.38 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  29.27 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  36.99 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  34.18 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  25.87 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 
230 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  31.3 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  30.87 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  28.71 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  30.59 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  27.01 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  28.8 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>