19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3905 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  296  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  30.23 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  39.33 
 
 
112 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  25.42 
 
 
188 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  25.42 
 
 
188 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  28.75 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  35.44 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  36.71 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1747  hypothetical protein  34.21 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  27.33 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  24.52 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  32.03 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  42.11 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  41.67 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  25 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>