47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4152 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  99.32 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  98.63 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  90.07 
 
 		 142 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  88.73 
 
 		 142 aa  260  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  89.36 
 
 		 142 aa  259  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  89.36 
 
 		 142 aa  258  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  88.65 
 
 		 142 aa  257  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  98.45 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  73.38 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  65.49 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  65.49 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  58.27 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  58.27 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  59.29 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  65.25 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  56.03 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  60.83 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  32.41 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  30.22 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  31.11 
 
 		 386 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  28.19 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  28.57 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  30.2 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  30.2 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1123 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  25.71 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  26.53 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  24.81 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  29.49 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  32.67 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  35 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  26.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  27.16 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>