44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4401 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  256  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  99.22 
 
 		 146 aa  254  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  98.45 
 
 		 146 aa  253  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  98.45 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  91.47 
 
 		 142 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  90.7 
 
 		 142 aa  236  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  90.7 
 
 		 142 aa  236  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  90.7 
 
 		 142 aa  236  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  89.92 
 
 		 142 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  74.42 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  68.22 
 
 		 153 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  68.22 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  62.02 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  62.02 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  62.02 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  68.22 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  59.69 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  62.62 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  33.57 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  35.97 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  35.96 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  31.37 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  31.06 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36 
 
 		 393 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  28.28 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  29.71 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1123 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  35.62 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  33.66 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  28.4 
 
 		 125 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.88 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  40.28 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.03 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.03 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  35.56 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>